内江市市中区辖区在殷商以前为以蜀族为主的氏族部落活动地区。殷商到战国时期，为古蜀国东部边境地区。秦至汉初，为蜀郡地。汉武帝建元六年（公元前140年），属资中县地。东汉顺帝年间（公元126～144年），析资中县以南地区置汉安县，取汉政权长治久安之意。北周武帝天和二年（公元567年），置汉安戌。同年，改置中江县。隋文帝开皇元年（公元581年），隋文帝因避父讳（其父名“忠”），遂改中江县为内江县。唐初至南宋，内江县疆域及隶属关系虽屡变，但县建置未变。元初，资州内江一带战乱频仍，地荒人稀，内江县废。元顺帝至正二十三年（公元1363年），复置内江县。元末至中华民国，内江县建置无大的变化。

1949年10月1日，中华人民共和国成立。12月6日，内江县解放。12月21日，川南行政公署资中区行政督察专员公署成立，内江县隶属资中区行政督察专员公署。1950年2月1日，资中区行政督察专员公署更名为川南行政公署内江区行政督察专员公署，内江县隶属内江区行政督察专员公署。9月29日，川南行政公署内江区行政督察专员公署更名为川南人民行政公署内江区专员公署，内江县隶属内江区专员公署。1951年7月17日，经中央人民政府内务部批准，设立内江市（内江专署辖市），以原内江县城区及东兴镇为内江市行政区域。9月25日，内江市人民政府正式成立。1952年8月，中央人民政府决定，撤销川东、川南、川西、川北行政公署，复置四川省。9月，川南行署内江区专员公署更名为四川省人民政府内江区专员公署，内江市隶属四川省内江区专员公署。1968年7月1日，内江地区革命委员会成立，内江市隶属内江地区。1985年2月11日，经国务院批准，撤销内江地区，内江市升为地级市，并设立内江市市中区，以原内江市的行政区域为内江市市中区的行政区域。5月29日，内江市（县级）第八届人民代表大会第三次会议决定，内江市人民政府更名为内江市市中区人民政府。6月1日，中共内江市市中区委、内江市市中区人民政府正式挂牌办公，行使职权。6月12日，内江市（地级）人民政府正式成立。新的地级内江市实行市管县体制，市中区隶属内江市。至2022年底，内江市市中区建置无变化。