水资源　自流井区常平均年降水量1000毫米～1100毫米，多平均年降水量为988.9毫米。

土地资源自流井区（含自贡高新区）耕地面积4446.59公顷，园地453.15公顷，林地4268.38公顷，草地18.44公顷，城镇村及工矿用地4303.74公顷，交通运输用地603.39公顷，水域及水利设施用地1012.44公顷。全区湿地面积202.04公顷，6个斑块。其中，河流湿地斑块3个，面积87.64公顷；湖泊库塘湿地斑块3个，面积114.40公顷。

矿产资源　自流井区属矿产资源贫乏地区，目前仅有页岩、地下水、矿泉水和砂石等少量资源。

生物资源　自流井区属亚热带常绿阔叶林地带，主要乔木植物有马尾松、湿地松、桉树、杨树、樟树、榕树、青冈、楠木、香椿、慈竹、麻竹、楠竹、柑橘、桃、李、梨、樱桃、枇杷等，灌木和藤本植物主要有黄荆、花椒、槐、桑树、油茶、茶、杜鹃等。湿地植物主要优势种有凤眼莲、喜旱莲子草、大薸、芦苇、睡莲、莲、鳢肠、浮萍等。野生动物主要有两栖动物5种，爬行动物10种，鸟类22种，兽类15种。